Variables
de configuration utilisées par R.DIAG
1) VARIABLES D'ENVIRONNEMENT
ARMNLIB
(Variable
obsolète qui
était utilisée entre autres choses comme point de départ de la recherche
de la documentation. Cette variable ne devrait plus etre utilisée.
Remplacée par la variable DIAGNOSTIQUE)
BIG_TMPDIR
(Répertoire
temporaire,
typiquement
créé à chaque début de session ("login") et détruit à
chaque fin de session ("logout"). Voir la variable USE_BIG_TEMPDIR
pour plus de détails. Selon la valeur de cette variable, il se peut que
les nouveaux fichiers soient par défaut créés dans ce répertoire, à
moins que leur nom ne contienne une disposition explicite de répertoire
telle que dans "./nomfich".
De plus, si un fichier d'entrée ne se trouve pas dans le répertoire
courant, les applications tenteront de le trouver dans ce BIG_TMPDIR)
DATE_FORMAT
(Chaine
de
caractères décrivant le format utilisé à la lecture d'une date en
argument sur la ligne de commande. Les valeurs reconnues vont de
'YYYYMMDDHHMMSS' à 'YYYYMM'. Il est également possible
d'utiliser 'TIMESTEP' pour spécifier des pas-de-temps. Valeur par
défaut: 'YYYYMMDDHH')
ECHO_COMMAND_LINE
(Demande
de reconstruire une copie de la ligne de commande et de l'afficher sur
stdout. Valeurs par défaut: no/non)
DEFAULT_PACKING_TYPE
(Spécifie
le type de compaction à être utilisé pour les fichiers de sortie. Les
valeurs supportées sont présentement sont PK84 (wkoffit
= 5), PK92 (wkoffit
= 4), SQ89 (wkoffit
= 2 ou 3)
et SQ98
(wkoffit=
33 ou 34).
Les fichiers standards CMC/RPN utilisent par définition un des types SQxx.
Ceux du CCCma utilisent présentement le type PK92. La valeur par défaut de la
variable, PK84,
corresponds à la version précédente de ces fichiers. Notez que les
fichiers RPN standard random 1989 (wkoffit
= 1) ne sont pas supportés par r.diag)
DIAGNOSTIC_EXIT
(Le
nom complet du fichier pouvant contenir les codes de complétions/erreurs
des travaux diagnostiques. Si ce fichier existe et est non-vide, r.diag
ne fera aucuns calculs. Si la variable est définie, les codes d'erreurs
fatales ne seront pas généres par un appel à EXIT et un message sera
plutôt écrit dans le fichier correspondant. Valeur par défaut: DIAGNOSTIC_EXIT)
DIAGNOSTIQUE
(Le
répertoire d'installation de r.diag sous
lequel se retrouveront les scripts et binaires du package, les codes
sources de ces binaires et toutes les pages de documentation en format
html et textuelle. Cette variable devrait être automatiquement définie
lors de l'activation SSM du package. Valeur par défaut: nil/aucune)
FREE_FORMAT_LEVEL_IO
(Indique
que la lecture des niveaux verticaux dans le modules concernés tels que
gsapl
et gpasg
se fera en format libre "*". Valeurs par défaut: no/non)
INFORM
(Activer
le mode informatif.
Peut aussi être activé par la clé -info à l'appel.
Valeur par défaut: non)
INPUT
(Nom
de fichier tenant lieu de stdin)
JOB
(Nom
du travail. Équivalent au paramètre "JN=" d'une carte JOB de CRAY/OS.
Cette variable n'est utilisée que lors de l'écriture de message
d'erreur. Il n'y a aucune valeur par défaut)
LEAP_YEAR_CONTROL
(Tenir
compte ou non des années bisextiles. Cette variable a préséance sur le
paramètre de ligne de commande -bisect
documenté plus bas et aussi sur la variable d'environnement
NEWDATE_OPTIONS mais alors seulement lorsqu'elle
est spécifiée)
MISSING_VALUE
(La
valeur réelle utilisée pour identifier les valeurs manquantes dans un
fichier. Un sous-ensemble restreint de modules a été équipé pour tenir
compte de ceci et leur documentation en fait alors état. Par défaut,
aucune valeur n'est définie. Un format de lecture FORTRAN E20.0 est
alors utilisé. Voir également le paramètre de ligne de commande -mvalue
plus bas)
NEWDATE_OPTIONS
(Variable
utilisée par la collection de routines NEWDATE de la librairie RMNLIB.
Ces routines sont utilisées dans tous les calculs de dates. Par défaut,
le calendrier utilisé est un calendrier Grégorien. Les valeurs
optionelles modifiant ce comportement sont "year=365_day" et
"year=360_day".
Tous les calendriers sont valides de l'an 1 à l'année 9999)
OUTPUT
(Nom
de fichier tenant lieu de stdout)
PAGER
(Le
nom du programme utilisé pour l'affichage des écrans de documentation.
Valeur par défaut: more)
TMPDIR
(Répertoire
temporaire,
typiquement
créé à chaque "login" et détruit à chaque "logout". Voir la variable USE_BIG_TEMPDIR
pour plus de détails. Selon la valeur de cette variable, il se
peut que les nouveaux fichiers soient par défaut crees dans ce
répertoire, à moins que leur nom ne contienne une disposition explicite
de répertoire telle que "./nomfich".
De plus, si un fichier d'entrée ne se trouve pas dans le répertoire
courant, les applications tenteront de le trouver dans ce TMPDIR)
USE_BIG_TMPDIR
(Placer
les fichiers locaux/temporaires dans BIG_TMPDIR plutot que
dans TMPDIR ? Sinon, BIG_TMPDIR est ignoré au
profit de TMPDIR. Si BIG_TMPDIR n'est pas définie, on
essayera d'utiliser TMPDIR. Au
moins l'une de ces deux variables doit être définie. Valeur par défaut:
oui)
USE_OLD_STYLE_IP1
(Utiliser
le type de codage compatible STD89 pour le paramètre représentant les
niveaux verticaux, i.e. IP1, dans l'écriture des fichiers STD98.
Valeur par défaut: non)
VERY_NICE_DIAG
(Permets
de changer la priorité d'exécution de r.diag dans la mesure où
celui-ci est généralement configuré pour tourner avec l'équivalent d'un
nice -19. Les valeurs possibles sont oui,
non ou bien une valeur numérique entre 1
et 19)
Les variables logiques décrites dans la
section précédente sont lues comme étant vraies lorsque qu'elles sont
définies avec des valeurs égale
à oui,
yes,
vrai, true ou
on.
Celles qui devraient être lues comme étant fausses le seront lorsque qu'elles sont
définies avec des valeurs égales
à non, no, faux,
false ou off.
2) CHEMIN D'ACCÈS (PATH)
La script accédant
à la plus récente version officielle du programme r.diag est disponibles dans
le répertoire
${DIAGNOSTIQUE}/scripts
3) DOCUMENTATION
La liste des
modules de commande et une courte description de chacun d'entre eux est
disponible en exécutant le module "lspgm" sans paramètre. Chaque
commande est de plus documentée de façon interne. Pour accéder à cette
information, il suffit d'invoquer r.diag avec comme seul
paramètre le nom de la commande, comme suit
r.diag
Command_Name
où Command_Name est remplacé par le
nom de la commande qui nous interésse.
La liste des codes
d'erreurs générés par les sous-routines de bas niveaux est également
disponible. Pour la consulter, il suffit d'exécuter la commande
suivante
r.diag
lssub
4) PARAMÈTRES GÉNÉRIQUES DE LA
LIGNE DE COMMANDE
Tous les commandes
connaissent un nombre limité de clés "génériques" affectant certains
aspects de leur fonctionnement. La routine ccard
est utilisée pour le traitement de ces options. Celles-ci sont
présentement:
-ipktyp
Valeur
(Spécifie
le type de compaction à être utilisée pour les fichiers d'entrées. Les
valeurs connues sont présentement PK84
et PK92. Cette clé permet de lire
les fichiers de type 1984 qui ont été écrits avec une version précédente
de r.diag)
-opktyp
Valeur
(Spécifie
le type de compaction a etre utilise pour les fichiers de sorties. Les
valeurs connues sont presentement PK84, PK92,
SQ89
et SQ98.
Cette clé a préséance sur la variable DEFAULT_PACKING_TYPE).
-help
(Active
le mode documentation. L'absence de tout paramètre active également ce
mode)
-info
[Valeur]
(Spécifie
la présence de messages d'erreurs des sous-routines. Par défaut, ceux-ci
ne sont pas imprimés. La valeur du paramètre peu indiquer le niveau de
sévérité des messages dans le cas des fichiers standards RPN, tel que
documenté par fstopc)
-vers
(Imprime
le numéro de révision de r.diag ainsi que celui de la version de
la programmathèque RMNLIB
qu'elle utilise)
-cendian
(Si
égal à BIG, les enregistrements de type
caractère CHAR sont
traités comme ayant été écrits en mode Big
Endian. Si égal à SMALL, ils seront traités comme Little Endian. La valeur par
défaut est BIG)
-mvalue Valeur1 [Valeur2]
(Valeur1
est ici le nombre réel utilisé pour identifier les valeurs manquantes
dans un fichier. De même, Valeur2 est le facteur relatif de
précision Epsilon qui sera utilisé dans les comparaisons avec cette
valeur manquante. La valeur par défaut de cet Epsilon est 1%.
Voir également la variable d'environnement MISSING_VALUE
ci-haut; la valeur manquante définie avec cette derniere variable à
préséance sur celle définie ici. Par défaut, cette valeur manquante est
inexistante)
-na
(Spécifie
si le programme doit arrêter le traitement en présence d'erreurs. Cette
clé controle le comportement dans un nombre très limité de situations)
-bisect [Valeur]
(Il
est
possible d'activer ou bien de désactiver le traitement des jours
bissextiles (eg. "Leap Years control"). La valeur logique de cet
argument est interprétée de la même manière que les valeur logique des
variables d'environnements, tel que décrit un peu plus
haut. Par défaut, les jours bissextiles sont pris en charge.)
-date
[Valeur]
(Si
ce paramètre est spécifié sans valeur, il indique que le deuxième mot du
tampon d'information qui sera lu dans un fichier de type CCC est une
date valide du 20ième siècle et non pas un pas de temps. Si
de plus, une valeur est spécifiée, celle-ci corresponds alors au siècle,
eg. 1800, 1900 ou 2000. A ne pas confondre avec le paramètre du même
nom dans le module CONVERT et qui doit contenir un
DATE-TIME-STAMP CMC/RPN)
-keepip2
(Lors
du traitement de fichiers CMC/RPN, r.diag tente toujours de se
conformer aux conventions associées aux clés temporelles, documentées ici. Certains
fichiers, tels que les fichiers de climatologie, peuvent ne pas adhérer
à cette convention. Lorsque cette cle est specifiée, une partie de cette
convention est ignorée, i.e. lorsque le descripteur interne deet est
nul. Dans ce cas, les ip2 sont conservés tels quels à la sortie)
-singlz
(Active
les modes de lecture et d'écriture en mode niveaux par niveaux qui
peuvent etre utilisés avec les coupes zonales)
Notez que la clé -ipktyp
ne devrait être utilisée qu'en dernier ressort. r.diag tente toujours de
déterminer lui-même le type de fichier d'entrée qu'on lui passe (voir
l'utilitaire RPN wkoffit
pour en savoir plus long sur la technique employée).
Enfin, certaines
commandes peuvent être invoquées avec un mode de fonctionnement
particulier en utilisant la clé -def
[Valeur1][...][ValeursN]. Cette clé signifie que la commande devra soit
d'utiliser ses valeurs par défaut (e.g. xlin),
soit d'utiliser un mode de fonctionnement alternatif (e.g. timcov).
Dans tous les cas, la présence de cette clé empêchera la lecture d'un
premier groupe d'arguments qui pourraient être définis via un
enregistrement (ligne) STDIN et ce, tel que décrit dans la documentation
des différents modules. Si d'autres variables sont normalement définies
via des enregistrements STDIN supplémentaires, celles-ci pourraient
également ne plus l'être ou l'être différemment, dépendant des valeurs
qui auront été définies avec cette clé (e.g. la liste de niveaux
verticaux qui seront utilisés dans gsapl et pgen) .
5) PARAMÈTRES SPÉCIFIQUES DE LA LIGNE DE COMMANDE
Un deuxième jeu de
clés décrivant des paramètres spécifiques aux différents modules tels
que les nombres de latitudes et longitudes, la troncature spectrale ou
bien le facteur de compaction est généralement disponible. Consultez la
documentation des différents modules pour en savoir plus long. Notez que
certaines valeurs telles que -cle="****"
, "N/A" ou "S/O" seront interprétées
comme une clé non spécifiée dans ce contexte. Ceci peut être utile
lorsqu'on veut spécifier une seule valeur d'une clé pouvant en avoir
plusieurs.
Par exemple, dans
cet appel de la commande zxplot, la première valeur de
la clé -lv1 ne sera pas définie:
r.diag zxplot fichier_zonal -lv1 N/A FULL
Notons que la liste
de toutes les clés supportées sera affichée aussitôt qu'une commande est
démarrée avec une clé non reconnue (i.e. -wxyz).
Enfin, un nom de
fichier peut être substitué par un "+" à l'appel. Ceci
indique à la commande (par le biais de la routine jclpnt) que l'unité d'E/S
correspondante ne doit pas etre ouverte. Cette substitution ne devrait
être utilisée qu'avec des commandes lisant/écrivant un nombre variable
de fichiers d'E/S.
6)
NOTES
- Il n'est pas permis d'utiliser dans un même appel des fichiers SQxx et des fichier de type PKxx.
La seule exception concerne le module convert
qui en plus de convertir d'un type de fichier à l'autre (et vice
versa), tente d'effectuer une traduction des noms de variables et de
leurs unités afin que ces variables se conforment aux standards
appropriés.
- Sauf exceptions, et seulement lorsqu'il est question de
fichiers CMC/RPN, les modules qui effectuent des traitement temporels
tels que accumul, timavg,
timcov et fstmdiag
(entre autres), modifient les descripteurs internes de ces fichiers de
telle sorte que la plus ancienne date d'échantillonnage sera sauvée
dans DATEO, tandis que la plus récente pourra être reconstruite à
partir des valeurs finales des paramètres DATEO, NPAS and DEET (i.e
dans DATEV). Le paramètre IP3 indiquera alors le nombre d'échantillons
temporels utilisés lors des calculs effectués dans les différents
modules. Lorsque l'ensemble des échantillons est complet (i.e.sans
trou), l'intervalle d'échantillonnage sera sauvé dans le paramètre
DEET. De plus, le second caractère du paramètre TYPVAR indiquera
le type de données temporelles en présence: / pour les
moyennes, % pour les variances, 1 pour les minimums, 5
pour les médianes, 7 pour les écarts types et 9 pour
les maximums. Les autres modules tels que timegem
et les différents modules de tests statistiques tels que ftest
et ttesta peuvent directement utiliser ces
informations. Notez que tous ces comportements peuvent par contre être
désalloués. Voir la documentation des différents modules pour plus de
détails.
- Les types de grilles CMC/RPN supportées par r.diag sont:
A,B,G,L,N,S,U,Y,Z,#.
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Contact :
Dugas.Bernard@uqam.ca
Dernière
mise-à-jour : décembre 2018
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